沙巴的交通还不算发达，公路网虽然普遍，乘搭巴士是可以到达各大小城镇，但是有些地方还是需要用船或四轮驱动车才能到达，普通小车轿车没有办法进入，造成偏远地方的人民教育和医疗设备较落后，水电供应不足，很多时候还需要动用直升机以飞到内陆地区，将病人送到大医院以进行救济。
陆路
在沙巴各大城市，都流行著迷你巴士（mini bus），当中业者水准参差不齐，还有一些霸王车。以前在亚庇、斗亚兰、兵南邦、丹容亚路各有三家比较大型的巴士公司既（Tuaran United Transport,TUT,Penampang United Transport,PUT 还有Luen Tong）在服务，现在只剩下PUT在川行了。在亚庇市区成功卫星市那里，也可以乘搭长途巴士或的士（出租车）去到山打根、斗湖、根地咬、兰脑、砂拉越州的老越等地方。
航空
乘搭飞机也是很多人的选择之一，这里的航空公司主要是马航及亚航。差不多每个城镇都有自己的飞机场，可是由于陆上交通的发达，有些已经荒废了。亚庇的国际机场是全国第二繁忙的飞机场，有直飞中国、台湾、日本、菲律宾等国际航线。
火车
沙巴还保留著婆罗洲唯一的铁轨，虽然它的光辉日子已不再，但是一些居民还是会搭火车到市区来。现在也用作观光用途，让游客一睹沙巴乡区的风景北婆罗洲铁道局.